1978 påbörjades ett storskaligt, tvärvetenskapligt forskningsprojekt i Gårdsjön och Hästevattnet. Senare flyttade studierna upp på land, in i de skogklädda avrinningsområdena runt sjön, där nedfall, mark- och grundvatten, avrinning och vegetation undersöktes. Forskningen innefattar idag också experimentella behandlingar som skogsavverkning, markalkning, svavel- och kvävetillförsel och skogsgödsling. 1990 invigdes Gårdsjöstugan, en informations-, konferens- och övernattningsanläggning för forskare och andra intresserade. I april 1991 startade ”Takprojektet” och ett EU-finansierat kväveforskningsprojekt som kallas NITREX. Det sistnämnda försöket kommer att pågå en bit in på 2000-talet medan plasten togs bort från taket 2001. Avrinningsvattnets kvalitet kommer dock även i fortsättningen att studeras.